“反转世界”是存在于这个世界内部的镜子般不可思议的世界。那个美丽而规则的世界，是骑拉帝纳栖居的特殊空间。然而帝牙卢卡和帕路奇犽的战斗造成了时空的()扭曲，“反转世界”也因此完全被阴霾笼罩。由于自己的世界被污染而被激怒的骑拉帝纳找到了帝牙卢卡，并想将其拖入反转世界中()。 　　“现实世界”，在继续旅行的小智和皮卡丘一行的面前出现了一个小小的，几乎看不()见的精灵。那是有“花媚”之称的感()谢神奇宝贝洁咪。被卷入帝牙卢卡和骑拉帝纳的战斗的洁咪在千钧一发之()际从反转()世界逃出。小智一行带着精疲力竭的洁咪前往神奇宝贝中心。 洁咪用心电感应将小智()一行带到了它的“葛拉西蒂亚花(グラシデア)花田”，并告诉他们在这“葛拉西蒂亚花”中隐藏着巨大的秘密。正准备离开神奇宝贝中心的小智等人遇到了前来捕捉()洁咪的火箭队()。而与()此同时，神奇宝贝中心外的装饰()品的镜面上出现了“次元旋涡”，将火箭队()、洁咪连同小智一行人一起全部带往了()反转世界。 　　从次元旋涡()中脱出的小智一行人环顾四周，这()里()是倒立着一排排建筑物，空()中处处漂浮着乌云的，广大而不()可()思议()的反转世界。 　　就在这时，骑拉帝纳突然出现，向()洁咪()发动攻()击。小智等人正要与骑拉帝纳对抗，却传来制止之声()。说话者是名叫穆玄·葛雷斯蓝()多的学者，他告诉小智等人不可以让骑拉帝纳生气。 　　正在小智一行在穆玄·葛雷斯蓝多的帮助()下向现实世界回返之时，企图()利用骑拉帝纳的力量支配世界的，驾驶着高科技母舰“百万力()霸”的谜之青年，杰洛出现了。和洁咪一()起()继续着探索花园之旅的小智一行没能逃过杰洛的追踪。 　　前所未有的冒()险之旅的高潮，等待着你的是超越想像的“美丽奇迹”!